温州医学院是浙江省省属高等院校，浙江省重点建设大学。学校的前身可追溯到1912年在杭州建立的浙江医学专门学校，原名“浙江第二医学院”，1958年8月由浙江医学院从杭州分迁至温州建立，当年开始招收五年制本科学生。1978年开始招收硕士研究生，1981年成为国务院首批批准的硕士学位授予单位。1998年获批准招收外国留学生和港澳台学生，2001年经国务院学位办批准与美国新英格兰视光学院联合培养博士研究生。2002年获批准招收七年制学生。2003年获批准为与浙江大学联合培养博士。2006年被批准为博士学位授予单位。经批准从2011年起开展推荐优秀应届本科毕业生免试攻读硕士研究生工作。2010年获得推荐免试攻读硕士学校现拥有外科学、妇产科学、眼科学3个二级学科博士点，临床医学、中药学2个一级学科硕士点、28个二级学科硕士点，临床医学一级学科博士后科研流动站1个，并拥有生物医学工程领域工程硕士、临床医学硕士专业学位、中西医结合临床、口腔医学硕士等4个专业学位授权点，1个七年制本硕连读专业，30个本科专业（其中眼视光学本科专业为教育部国家级人才培养模式创新实验区建设项目，临床医学本科专业为国家第一类特色专业建设点）。2010级新生入学后，全日制在校博士研究生近70人、硕士研究生达2000多人。温州医学院现已成为浙江省医学人才培养的主要基地。

我校1993年获得副教授评审权，2007年获得教授评审权，现有教授等正高级职称234人、副高职称363人，一批优秀教师入选国家“百千万人才工程”、“教育部新世纪优秀人才支持计划” 、浙江省特级专家、浙江省高校特聘教授、浙江省“151人才工程””、浙江省有突出贡献的中青年科技专家、浙江省高校中青年学科带头人。目前学校占地1290多亩，校舍建筑面积50余万平方米，学校拥有5所附属医院（其中4所为三级甲等医院）和12所非直管附属医院（临床学院），总床位万余张，另外附属第一医院人类辅助生殖技术中心是国家卫生部首批批准的五个人类辅助生殖技术中心之一，附属第一医院还设有国家药品临床研究基地，附属第二医院设有浙江省脊椎外科中心。

我校树立特色学科优先发展、优势学科集聚发展、扶植学科重点发展的战略，不断提升学校核心竞争力。近三年来，我校承担包括国家863项目、国家“十一五”攻关课题、国家“973”前期研究专项、国家自然科学基金等省部级以上研究项目370多项，其中国家级科研项目150多项；并获国家级、省部级科技进步奖和教学成果奖35项，其中获国家技术发明奖二等奖1项、国家科技进步二等奖3项（1项为第二作者）、中华医学科技奖一等奖1项、中国药学会科技奖一等奖1项、浙江省科学技术奖一等奖3项，获国家级教学成果二等奖2项、省级教学成果奖一等奖3项。我校拥有省“重中之重学科”4个、省高校重点学科10个、省医学重点学科群1个、省医学重点和重点扶植学科15个、省示范中医科1个、省中医药重点学科3个、省中医药重点扶植学科1个、省中医药重点专科7个。有省部共建国家重点实验培育基地1个、省部共建教育部重点实验室1个、省部共建教育部重点工程研究中心1个、卫生部重点实验室1个、省重点实验室4个、省中医药重点实验室2个。形成了一批诸如眼视光学、外科学、临床检验诊断学、药学、妇产科学、儿科学、麻醉学、内科学、遗传学等独具特色的学科。

学校主办、编辑出版的学术刊物有《温州医学院学报》、《中华眼视光学与视觉科学杂志》、《肝胆胰外科杂志》、《浙江创伤外科》和《检验医学教育》等五种，其中前三种入选“中国科技核心期刊”，《中华眼视光学与视觉科学杂志》为中华医学会系列杂志。

我校一贯重视国际学术交流与合作，不断拓宽合作渠道，已先后与美国、加拿大、英国、奥地利、法国、澳大利亚、日本、泰国、印度、香港、台湾等国家和地区的五十多所知名高等院校和科研机构建立了良好的交流合作关系，包括联合培养博士、互派学者、互派留学生等各种形式的合作项目，分别与泰国东方大学、纽约州立大学合作成立了孔子学院。其中与美国新英格兰视光学院联合培养眼视光学博士项目作为我国第一个经国务院学位办批准的中外合作办学培养博士层次的项目，以优秀的成绩通过中美两国管理机构的评估并获高度评价。